Isla Contoy is een natuurlijk beschermd gebied dat is uitgeroepen tot nationaal park vanwege zijn uitzonderlijke natuurlijke omstandigheden; bovendien is het één van de weinige Caribische eilanden die zijn ecosystemen intact houdt.
Het water rond Contoy is zeer rijk aan voedingsstoffen die als voedsel dienen voor de plancton die het dieet vormt van meer dan 234 vissoorten die in het gebied zijn geïdentificeerd, waaronder de majestueuze walvishaaien en Mantaroggen die zich voor de kust voeden.