Les requins-baleines sont considérés comme « vulnérables à l’extinction » et figurent sur la liste rouge des espèces menacées.
Ils sont en danger en raison des menaces résultant des activités humaines, notamment les crèmes solaires non biodégradables, les déversements de plastique/déchets/toxines/pétrole dans l’océan, la coupe des ailerons des requins, la prise dans les filets de pêche, et même pour le sport.