Isla Contoy est une zone naturelle protégée décrétée parc national pour ses conditions naturelles exceptionnelles; en outre, elle est l’une des rares îles des Caraïbes à conserver ses écosystèmes intacts.
L’eau autour de Contoy est très riche en nutriments qui servent de nourriture au plancton qui constitue le régime alimentaire de plus de 234 espèces de poissons qui ont été identifiées dans la région, y compris les majestueux requins-baleines et raies Manta qui se nourrissent sur ses côtes.