Walhaie gelten als „vom Aussterben bedroht“ und stehen auf der Roten Liste der bedrohten Tierarten.
Sie sind durch menschliche Aktivitäten bedroht, z. B. durch biologisch nicht abbaubare Sonnenschutzmittel, Plastikabfälle, Giftstoffe und Ölverschmutzungen im Meer, durch das Abschneiden von Haifischflossen, durch den Fang in Fischernetzen und sogar durch den Sport.